• лицензия УФСБ России по Пензенской области Б 339342 регистрационный номер 582 от 19 декабря 2007 г. Лицензия разрешает осуществление работ с использованием сведений, составляющих государственную тайну. Срок действия лицензии – до 01 февраля 2014 г.;
• лицензия УФСБ Российской Федерации по Пензенской области ЛЗ № 0008407 Рег.№622 Р от 12 мая 2008 г. на осуществление распространения шифровальных (криптографических) средств. Срок действия лицензии – до 12 мая 2013 г.;
• лицензия УФСБ Российской Федерации по Пензенской области ЛЗ №0008408 Рег.№623 Х от 12 мая 2008г. Лицензия разрешает осуществление технического обслуживания шифровальных (криптографических) средств. Срок действия лицензии – до 12 мая 2013г.;
• лицензия УФСБ Российской Федерации по Пензенской области ЛЗ № 0008409 Рег.№624 У от 12 мая 2008г. Лицензия разрешает предоставлять услуги в области шифрования информации. Срок действия лицензии – до 12 мая 2013г.;
• лицензия Центра по лицензированию, сертификации и защите государственной тайны ФСБ России ЛЗ №0015202 Рег.№5600П от 29 мая 2008г. Лицензия разрешает осуществлять разработку, производство шифровальных (криптографических) средств информационных и телекоммуникационных систем. Срок действия лицензии – до 29 мая 2013г.;
• лицензия ФСТЭК России серия КИ 0045 номер 002203 на деятельность по разработке и (или) производству средств защиты конфиденциальной информации Регистрационный номер 0472 от 3 февраля 2009г. Срок действия лицензии – до 3 февраля 2014г.;
• лицензия ФСТЭК России серия КИ 0062 номер 003078 на деятельность по технической защите конфиденциальной информации Регистрационный номер 1151 от 18 июня 2010г. Срок действия лицензии – до 18 июня 2015г.;
• лицензия ФСТЭК России серия ГТ 0103 номер 005119 на осуществление мероприятий и (или) оказание услуг в области защиты государственной тайны. Регистрационный номер 79 от 1 октября 2010г. Срок действия лицензии – до 1 октября 2015г.;
• лицензия ФСТЭК России серия ГТ 0103 номер 005120 на проведение работ, связанных с созданием средств защиты информации. Регистрационный номер 1614 от 1 октября 2010г. Срок действия лицензии – до 1 октября 2015г.

Сопровождение работ, проводимых НПФ «Кристалл» по государственным контрактам, осуществляется 5021 ВП МО РФ.

В соответствии с разрешением Управления ФСБ по Пензенской области (исх.№6/17-1856 от 21.08.2001) с 01.09.2001 в НПФ «Кристалл» действует собственный аттестованный режимно-секретный орган.